Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms