Protein–RNA interactions for Protein: Q92837

FRAT1, Proto-oncogene FRAT1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRAT1Q92837 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms