Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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RABGGTAQ92696 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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RABGGTAQ92696 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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RABGGTAQ92696 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
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