Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CARMIL3Q8ND23 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CARMIL3Q8ND23 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CARMIL3Q8ND23 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CARMIL3Q8ND23 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CARMIL3Q8ND23 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CARMIL3Q8ND23 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CARMIL3Q8ND23 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CARMIL3Q8ND23 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CARMIL3Q8ND23 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CARMIL3Q8ND23 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CARMIL3Q8ND23 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CARMIL3Q8ND23 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CARMIL3Q8ND23 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CARMIL3Q8ND23 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CARMIL3Q8ND23 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CARMIL3Q8ND23 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CARMIL3Q8ND23 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CARMIL3Q8ND23 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CARMIL3Q8ND23 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CARMIL3Q8ND23 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CARMIL3Q8ND23 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CARMIL3Q8ND23 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CARMIL3Q8ND23 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CARMIL3Q8ND23 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CARMIL3Q8ND23 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CARMIL3Q8ND23 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CARMIL3Q8ND23 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CARMIL3Q8ND23 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CARMIL3Q8ND23 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CARMIL3Q8ND23 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CARMIL3Q8ND23 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CARMIL3Q8ND23 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CARMIL3Q8ND23 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CARMIL3Q8ND23 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CARMIL3Q8ND23 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CARMIL3Q8ND23 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CARMIL3Q8ND23 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CARMIL3Q8ND23 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CARMIL3Q8ND23 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CARMIL3Q8ND23 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CARMIL3Q8ND23 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CARMIL3Q8ND23 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CARMIL3Q8ND23 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CARMIL3Q8ND23 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CARMIL3Q8ND23 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CARMIL3Q8ND23 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CARMIL3Q8ND23 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CARMIL3Q8ND23 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CARMIL3Q8ND23 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CARMIL3Q8ND23 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CARMIL3Q8ND23 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CARMIL3Q8ND23 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CARMIL3Q8ND23 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CARMIL3Q8ND23 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CARMIL3Q8ND23 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CARMIL3Q8ND23 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CARMIL3Q8ND23 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CARMIL3Q8ND23 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CARMIL3Q8ND23 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CARMIL3Q8ND23 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CARMIL3Q8ND23 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CARMIL3Q8ND23 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CARMIL3Q8ND23 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CARMIL3Q8ND23 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CARMIL3Q8ND23 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CARMIL3Q8ND23 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CARMIL3Q8ND23 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CARMIL3Q8ND23 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CARMIL3Q8ND23 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CARMIL3Q8ND23 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CARMIL3Q8ND23 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CARMIL3Q8ND23 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CARMIL3Q8ND23 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CARMIL3Q8ND23 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CARMIL3Q8ND23 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CARMIL3Q8ND23 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CARMIL3Q8ND23 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CARMIL3Q8ND23 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CARMIL3Q8ND23 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CARMIL3Q8ND23 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CARMIL3Q8ND23 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CARMIL3Q8ND23 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CARMIL3Q8ND23 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CARMIL3Q8ND23 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 361.1 ms