Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms