Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Y2

LRRC17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17Q8N6Y2 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms