Protein–RNA interactions for Protein: Q8N448

LNX2, Ligand of Numb protein X 2, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNX2Q8N448 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms