Protein–RNA interactions for Protein: Q8N398

VWA5B2, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B2, humanhuman

Predictions only

Length 1,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA5B2Q8N398 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VWA5B2Q8N398 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VWA5B2Q8N398 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VWA5B2Q8N398 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VWA5B2Q8N398 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VWA5B2Q8N398 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
VWA5B2Q8N398 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VWA5B2Q8N398 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VWA5B2Q8N398 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VWA5B2Q8N398 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VWA5B2Q8N398 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VWA5B2Q8N398 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VWA5B2Q8N398 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
VWA5B2Q8N398 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
VWA5B2Q8N398 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
VWA5B2Q8N398 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
VWA5B2Q8N398 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VWA5B2Q8N398 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VWA5B2Q8N398 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VWA5B2Q8N398 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VWA5B2Q8N398 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VWA5B2Q8N398 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VWA5B2Q8N398 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VWA5B2Q8N398 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VWA5B2Q8N398 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
VWA5B2Q8N398 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VWA5B2Q8N398 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VWA5B2Q8N398 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VWA5B2Q8N398 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VWA5B2Q8N398 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VWA5B2Q8N398 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VWA5B2Q8N398 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VWA5B2Q8N398 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VWA5B2Q8N398 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
VWA5B2Q8N398 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
VWA5B2Q8N398 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VWA5B2Q8N398 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VWA5B2Q8N398 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VWA5B2Q8N398 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VWA5B2Q8N398 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VWA5B2Q8N398 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VWA5B2Q8N398 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VWA5B2Q8N398 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VWA5B2Q8N398 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VWA5B2Q8N398 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VWA5B2Q8N398 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VWA5B2Q8N398 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VWA5B2Q8N398 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VWA5B2Q8N398 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VWA5B2Q8N398 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VWA5B2Q8N398 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VWA5B2Q8N398 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA5B2Q8N398 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA5B2Q8N398 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA5B2Q8N398 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA5B2Q8N398 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA5B2Q8N398 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA5B2Q8N398 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA5B2Q8N398 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA5B2Q8N398 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA5B2Q8N398 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA5B2Q8N398 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA5B2Q8N398 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA5B2Q8N398 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA5B2Q8N398 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA5B2Q8N398 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA5B2Q8N398 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA5B2Q8N398 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA5B2Q8N398 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA5B2Q8N398 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA5B2Q8N398 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA5B2Q8N398 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA5B2Q8N398 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA5B2Q8N398 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA5B2Q8N398 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA5B2Q8N398 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA5B2Q8N398 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA5B2Q8N398 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA5B2Q8N398 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA5B2Q8N398 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA5B2Q8N398 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA5B2Q8N398 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA5B2Q8N398 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA5B2Q8N398 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA5B2Q8N398 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA5B2Q8N398 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA5B2Q8N398 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA5B2Q8N398 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA5B2Q8N398 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA5B2Q8N398 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA5B2Q8N398 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA5B2Q8N398 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA5B2Q8N398 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA5B2Q8N398 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA5B2Q8N398 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA5B2Q8N398 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA5B2Q8N398 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA5B2Q8N398 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA5B2Q8N398 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA5B2Q8N398 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms