Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV32

CCDC71, Coiled-coil domain-containing protein 71, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71Q8IV32 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC71Q8IV32 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms