Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU67

BEND4, BEN domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND4Q6ZU67 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEND4Q6ZU67 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BEND4Q6ZU67 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEND4Q6ZU67 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEND4Q6ZU67 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEND4Q6ZU67 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEND4Q6ZU67 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEND4Q6ZU67 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEND4Q6ZU67 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEND4Q6ZU67 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEND4Q6ZU67 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEND4Q6ZU67 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEND4Q6ZU67 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEND4Q6ZU67 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEND4Q6ZU67 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEND4Q6ZU67 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEND4Q6ZU67 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEND4Q6ZU67 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEND4Q6ZU67 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEND4Q6ZU67 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEND4Q6ZU67 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEND4Q6ZU67 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEND4Q6ZU67 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BEND4Q6ZU67 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEND4Q6ZU67 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEND4Q6ZU67 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEND4Q6ZU67 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEND4Q6ZU67 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEND4Q6ZU67 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BEND4Q6ZU67 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEND4Q6ZU67 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEND4Q6ZU67 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEND4Q6ZU67 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEND4Q6ZU67 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEND4Q6ZU67 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEND4Q6ZU67 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEND4Q6ZU67 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEND4Q6ZU67 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEND4Q6ZU67 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEND4Q6ZU67 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEND4Q6ZU67 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEND4Q6ZU67 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEND4Q6ZU67 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEND4Q6ZU67 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEND4Q6ZU67 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BEND4Q6ZU67 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEND4Q6ZU67 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEND4Q6ZU67 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BEND4Q6ZU67 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
BEND4Q6ZU67 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BEND4Q6ZU67 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BEND4Q6ZU67 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BEND4Q6ZU67 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BEND4Q6ZU67 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BEND4Q6ZU67 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BEND4Q6ZU67 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BEND4Q6ZU67 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BEND4Q6ZU67 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BEND4Q6ZU67 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BEND4Q6ZU67 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BEND4Q6ZU67 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BEND4Q6ZU67 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms