Protein–RNA interactions for Protein: Q69YN4

VIRMA, Protein virilizer homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIRMAQ69YN4 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VIRMAQ69YN4 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms