Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3C3

TMEM164, Transmembrane protein 164, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM164Q5U3C3 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms