Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms