Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms