Protein–RNA interactions for Protein: Q504Q3

PAN2, PAN2-PAN3 deadenylation complex catalytic subunit PAN2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN2Q504Q3 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAN2Q504Q3 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PAN2Q504Q3 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PAN2Q504Q3 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PAN2Q504Q3 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAN2Q504Q3 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAN2Q504Q3 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAN2Q504Q3 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PAN2Q504Q3 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAN2Q504Q3 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAN2Q504Q3 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAN2Q504Q3 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAN2Q504Q3 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PAN2Q504Q3 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PAN2Q504Q3 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAN2Q504Q3 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAN2Q504Q3 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAN2Q504Q3 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAN2Q504Q3 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAN2Q504Q3 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAN2Q504Q3 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAN2Q504Q3 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAN2Q504Q3 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAN2Q504Q3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAN2Q504Q3 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAN2Q504Q3 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAN2Q504Q3 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAN2Q504Q3 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAN2Q504Q3 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PAN2Q504Q3 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAN2Q504Q3 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAN2Q504Q3 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAN2Q504Q3 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAN2Q504Q3 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAN2Q504Q3 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAN2Q504Q3 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAN2Q504Q3 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAN2Q504Q3 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAN2Q504Q3 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAN2Q504Q3 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAN2Q504Q3 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAN2Q504Q3 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAN2Q504Q3 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAN2Q504Q3 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAN2Q504Q3 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAN2Q504Q3 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAN2Q504Q3 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAN2Q504Q3 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAN2Q504Q3 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PAN2Q504Q3 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAN2Q504Q3 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAN2Q504Q3 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAN2Q504Q3 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAN2Q504Q3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAN2Q504Q3 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAN2Q504Q3 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAN2Q504Q3 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAN2Q504Q3 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAN2Q504Q3 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAN2Q504Q3 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAN2Q504Q3 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAN2Q504Q3 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAN2Q504Q3 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAN2Q504Q3 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAN2Q504Q3 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAN2Q504Q3 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAN2Q504Q3 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAN2Q504Q3 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAN2Q504Q3 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAN2Q504Q3 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PAN2Q504Q3 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAN2Q504Q3 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAN2Q504Q3 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAN2Q504Q3 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAN2Q504Q3 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAN2Q504Q3 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAN2Q504Q3 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAN2Q504Q3 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PAN2Q504Q3 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PAN2Q504Q3 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PAN2Q504Q3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAN2Q504Q3 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAN2Q504Q3 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAN2Q504Q3 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAN2Q504Q3 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAN2Q504Q3 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAN2Q504Q3 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAN2Q504Q3 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAN2Q504Q3 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.2 ms