Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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