Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
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