Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNA2Q15822 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms