Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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EFNB3Q15768 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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EFNB3Q15768 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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EFNB3Q15768 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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EFNB3Q15768 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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