Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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PUM3Q15397 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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PUM3Q15397 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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PUM3Q15397 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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PUM3Q15397 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
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PUM3Q15397 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
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