Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

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Length 657 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
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PTPRRQ15256 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
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PTPRRQ15256 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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PTPRRQ15256 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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PTPRRQ15256 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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PTPRRQ15256 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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PTPRRQ15256 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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PTPRRQ15256 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
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PTPRRQ15256 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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PTPRRQ15256 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
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PTPRRQ15256 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
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