Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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SMCO1Q147U7 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
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