Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms