Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
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CUL4AQ13619 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
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CUL4AQ13619 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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CUL4AQ13619 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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CUL4AQ13619 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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CUL4AQ13619 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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CUL4AQ13619 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
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