Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRQ13535 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRQ13535 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRQ13535 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRQ13535 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRQ13535 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRQ13535 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRQ13535 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRQ13535 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRQ13535 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRQ13535 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRQ13535 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRQ13535 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRQ13535 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRQ13535 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRQ13535 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRQ13535 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRQ13535 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRQ13535 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRQ13535 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRQ13535 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ATRQ13535 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ATRQ13535 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ATRQ13535 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ATRQ13535 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ATRQ13535 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ATRQ13535 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ATRQ13535 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRQ13535 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRQ13535 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRQ13535 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRQ13535 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRQ13535 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRQ13535 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRQ13535 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRQ13535 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRQ13535 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRQ13535 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRQ13535 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRQ13535 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRQ13535 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRQ13535 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRQ13535 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRQ13535 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRQ13535 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRQ13535 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRQ13535 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRQ13535 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRQ13535 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRQ13535 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRQ13535 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRQ13535 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRQ13535 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRQ13535 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRQ13535 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRQ13535 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRQ13535 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRQ13535 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRQ13535 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRQ13535 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRQ13535 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRQ13535 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRQ13535 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRQ13535 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRQ13535 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRQ13535 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRQ13535 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRQ13535 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRQ13535 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRQ13535 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRQ13535 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRQ13535 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRQ13535 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRQ13535 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRQ13535 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRQ13535 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRQ13535 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRQ13535 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRQ13535 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRQ13535 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRQ13535 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRQ13535 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRQ13535 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRQ13535 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRQ13535 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRQ13535 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRQ13535 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRQ13535 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRQ13535 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRQ13535 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRQ13535 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRQ13535 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRQ13535 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRQ13535 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRQ13535 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRQ13535 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRQ13535 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRQ13535 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRQ13535 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRQ13535 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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