Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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SLAMF1Q13291 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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SLAMF1Q13291 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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