Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NME3Q13232 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NME3Q13232 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NME3Q13232 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NME3Q13232 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NME3Q13232 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NME3Q13232 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NME3Q13232 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NME3Q13232 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NME3Q13232 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NME3Q13232 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NME3Q13232 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NME3Q13232 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NME3Q13232 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NME3Q13232 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NME3Q13232 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NME3Q13232 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME3Q13232 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME3Q13232 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME3Q13232 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME3Q13232 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME3Q13232 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME3Q13232 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME3Q13232 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME3Q13232 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME3Q13232 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME3Q13232 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME3Q13232 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME3Q13232 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME3Q13232 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME3Q13232 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME3Q13232 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME3Q13232 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME3Q13232 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME3Q13232 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME3Q13232 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME3Q13232 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME3Q13232 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME3Q13232 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME3Q13232 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME3Q13232 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME3Q13232 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NME3Q13232 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME3Q13232 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME3Q13232 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME3Q13232 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NME3Q13232 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME3Q13232 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME3Q13232 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME3Q13232 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME3Q13232 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME3Q13232 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME3Q13232 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME3Q13232 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME3Q13232 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME3Q13232 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME3Q13232 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME3Q13232 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME3Q13232 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME3Q13232 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME3Q13232 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME3Q13232 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME3Q13232 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME3Q13232 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NME3Q13232 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME3Q13232 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME3Q13232 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME3Q13232 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NME3Q13232 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME3Q13232 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME3Q13232 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME3Q13232 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME3Q13232 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NME3Q13232 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME3Q13232 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME3Q13232 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME3Q13232 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NME3Q13232 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME3Q13232 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NME3Q13232 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NME3Q13232 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NME3Q13232 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME3Q13232 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME3Q13232 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME3Q13232 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NME3Q13232 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NME3Q13232 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NME3Q13232 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NME3Q13232 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NME3Q13232 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NME3Q13232 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NME3Q13232 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NME3Q13232 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NME3Q13232 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NME3Q13232 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NME3Q13232 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NME3Q13232 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NME3Q13232 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NME3Q13232 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NME3Q13232 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms