Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
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