Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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FOXD4Q12950 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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FOXD4Q12950 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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FOXD4Q12950 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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FOXD4Q12950 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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