Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
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NFIAQ12857 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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NFIAQ12857 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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NFIAQ12857 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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NFIAQ12857 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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NFIAQ12857 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
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