Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms