Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LTBQ06643 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LTBQ06643 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LTBQ06643 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LTBQ06643 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LTBQ06643 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LTBQ06643 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LTBQ06643 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LTBQ06643 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LTBQ06643 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LTBQ06643 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LTBQ06643 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LTBQ06643 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LTBQ06643 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LTBQ06643 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LTBQ06643 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LTBQ06643 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LTBQ06643 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LTBQ06643 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LTBQ06643 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LTBQ06643 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LTBQ06643 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LTBQ06643 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LTBQ06643 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LTBQ06643 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LTBQ06643 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LTBQ06643 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LTBQ06643 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LTBQ06643 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LTBQ06643 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LTBQ06643 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LTBQ06643 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LTBQ06643 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LTBQ06643 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LTBQ06643 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LTBQ06643 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LTBQ06643 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LTBQ06643 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LTBQ06643 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LTBQ06643 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LTBQ06643 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LTBQ06643 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LTBQ06643 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LTBQ06643 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LTBQ06643 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LTBQ06643 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LTBQ06643 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LTBQ06643 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBQ06643 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBQ06643 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBQ06643 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBQ06643 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBQ06643 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBQ06643 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBQ06643 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBQ06643 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBQ06643 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBQ06643 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBQ06643 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBQ06643 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBQ06643 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBQ06643 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBQ06643 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBQ06643 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBQ06643 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBQ06643 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBQ06643 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBQ06643 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBQ06643 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBQ06643 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBQ06643 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBQ06643 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBQ06643 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBQ06643 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBQ06643 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBQ06643 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBQ06643 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBQ06643 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBQ06643 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBQ06643 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBQ06643 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBQ06643 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBQ06643 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBQ06643 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBQ06643 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBQ06643 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBQ06643 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBQ06643 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBQ06643 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBQ06643 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBQ06643 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBQ06643 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBQ06643 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBQ06643 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBQ06643 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBQ06643 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBQ06643 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBQ06643 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBQ06643 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBQ06643 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms