Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms