Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms