Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms