Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 ARPC3-201ENST00000228825 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 AC069540.1-201ENST00000446320 988 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 AP000547.1-201ENST00000454360 617 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 KCTD10P1-201ENST00000434203 625 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 AL133247.1-201ENST00000435713 646 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 BTG3P1-201ENST00000435859 716 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 MTCO3P16-201ENST00000454456 754 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 THAP6-212ENST00000508105 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 AL133304.2-201ENST00000546376 886 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 AC074051.4-201ENST00000564888 892 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 TRIM64FP-201ENST00000427305 1371 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms