Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
XPCQ01831 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
XPCQ01831 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
XPCQ01831 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
XPCQ01831 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
XPCQ01831 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
XPCQ01831 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
XPCQ01831 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
XPCQ01831 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
XPCQ01831 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
XPCQ01831 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
XPCQ01831 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
XPCQ01831 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
XPCQ01831 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
XPCQ01831 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
XPCQ01831 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
XPCQ01831 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
XPCQ01831 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
XPCQ01831 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
XPCQ01831 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
XPCQ01831 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
XPCQ01831 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
XPCQ01831 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
XPCQ01831 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
XPCQ01831 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
XPCQ01831 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
XPCQ01831 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
XPCQ01831 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
XPCQ01831 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
XPCQ01831 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
XPCQ01831 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
XPCQ01831 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
XPCQ01831 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
XPCQ01831 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
XPCQ01831 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
XPCQ01831 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
XPCQ01831 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
XPCQ01831 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
XPCQ01831 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
XPCQ01831 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
XPCQ01831 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
XPCQ01831 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
XPCQ01831 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
XPCQ01831 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
XPCQ01831 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
XPCQ01831 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
XPCQ01831 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
XPCQ01831 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
XPCQ01831 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
XPCQ01831 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
XPCQ01831 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
XPCQ01831 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
XPCQ01831 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
XPCQ01831 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
XPCQ01831 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
XPCQ01831 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
XPCQ01831 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
XPCQ01831 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
XPCQ01831 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
XPCQ01831 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
XPCQ01831 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
XPCQ01831 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
XPCQ01831 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
XPCQ01831 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
XPCQ01831 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
XPCQ01831 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
XPCQ01831 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
XPCQ01831 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
XPCQ01831 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
XPCQ01831 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
XPCQ01831 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
XPCQ01831 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
XPCQ01831 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
XPCQ01831 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
XPCQ01831 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
XPCQ01831 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
XPCQ01831 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
XPCQ01831 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
XPCQ01831 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
XPCQ01831 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
XPCQ01831 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
XPCQ01831 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
XPCQ01831 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
XPCQ01831 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
XPCQ01831 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
XPCQ01831 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
XPCQ01831 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
XPCQ01831 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
XPCQ01831 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
XPCQ01831 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
XPCQ01831 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
XPCQ01831 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
XPCQ01831 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
XPCQ01831 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
XPCQ01831 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
XPCQ01831 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
XPCQ01831 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
XPCQ01831 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
XPCQ01831 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
XPCQ01831 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms