Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms