Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms