Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms