Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMF1P82094 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMF1P82094 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMF1P82094 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMF1P82094 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TMF1P82094 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMF1P82094 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMF1P82094 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMF1P82094 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMF1P82094 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMF1P82094 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMF1P82094 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMF1P82094 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMF1P82094 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMF1P82094 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMF1P82094 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMF1P82094 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMF1P82094 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMF1P82094 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMF1P82094 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMF1P82094 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMF1P82094 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMF1P82094 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMF1P82094 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMF1P82094 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMF1P82094 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMF1P82094 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMF1P82094 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMF1P82094 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMF1P82094 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMF1P82094 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMF1P82094 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMF1P82094 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMF1P82094 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TMF1P82094 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMF1P82094 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMF1P82094 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMF1P82094 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMF1P82094 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMF1P82094 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMF1P82094 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMF1P82094 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMF1P82094 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMF1P82094 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMF1P82094 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMF1P82094 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMF1P82094 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMF1P82094 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMF1P82094 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMF1P82094 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMF1P82094 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMF1P82094 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TMF1P82094 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMF1P82094 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TMF1P82094 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMF1P82094 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMF1P82094 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMF1P82094 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMF1P82094 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMF1P82094 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMF1P82094 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMF1P82094 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMF1P82094 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMF1P82094 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMF1P82094 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMF1P82094 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMF1P82094 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMF1P82094 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMF1P82094 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMF1P82094 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMF1P82094 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMF1P82094 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMF1P82094 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TMF1P82094 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMF1P82094 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TMF1P82094 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMF1P82094 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMF1P82094 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMF1P82094 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TMF1P82094 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMF1P82094 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMF1P82094 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TMF1P82094 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMF1P82094 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMF1P82094 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMF1P82094 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMF1P82094 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMF1P82094 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMF1P82094 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMF1P82094 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMF1P82094 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMF1P82094 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMF1P82094 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMF1P82094 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMF1P82094 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMF1P82094 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMF1P82094 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMF1P82094 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMF1P82094 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMF1P82094 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms