Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SH3BP2P78314 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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