Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HERVK_113P62684 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
HERVK_113P62684 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HERVK_113P62684 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HERVK_113P62684 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
HERVK_113P62684 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HERVK_113P62684 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
HERVK_113P62684 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
HERVK_113P62684 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
HERVK_113P62684 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HERVK_113P62684 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HERVK_113P62684 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HERVK_113P62684 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HERVK_113P62684 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HERVK_113P62684 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HERVK_113P62684 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
HERVK_113P62684 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HERVK_113P62684 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HERVK_113P62684 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HERVK_113P62684 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HERVK_113P62684 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HERVK_113P62684 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HERVK_113P62684 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
HERVK_113P62684 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HERVK_113P62684 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HERVK_113P62684 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HERVK_113P62684 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HERVK_113P62684 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HERVK_113P62684 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HERVK_113P62684 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HERVK_113P62684 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HERVK_113P62684 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HERVK_113P62684 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HERVK_113P62684 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HERVK_113P62684 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HERVK_113P62684 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HERVK_113P62684 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HERVK_113P62684 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HERVK_113P62684 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HERVK_113P62684 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HERVK_113P62684 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HERVK_113P62684 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HERVK_113P62684 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HERVK_113P62684 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HERVK_113P62684 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HERVK_113P62684 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
HERVK_113P62684 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
HERVK_113P62684 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HERVK_113P62684 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HERVK_113P62684 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HERVK_113P62684 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HERVK_113P62684 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HERVK_113P62684 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HERVK_113P62684 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HERVK_113P62684 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
HERVK_113P62684 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
HERVK_113P62684 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
HERVK_113P62684 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HERVK_113P62684 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HERVK_113P62684 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HERVK_113P62684 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HERVK_113P62684 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HERVK_113P62684 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HERVK_113P62684 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HERVK_113P62684 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HERVK_113P62684 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HERVK_113P62684 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HERVK_113P62684 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HERVK_113P62684 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HERVK_113P62684 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HERVK_113P62684 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HERVK_113P62684 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HERVK_113P62684 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HERVK_113P62684 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HERVK_113P62684 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HERVK_113P62684 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HERVK_113P62684 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HERVK_113P62684 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HERVK_113P62684 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HERVK_113P62684 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HERVK_113P62684 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms