Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
RPS29P62273 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
RPS29P62273 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
RPS29P62273 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
RPS29P62273 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
RPS29P62273 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
RPS29P62273 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
RPS29P62273 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
RPS29P62273 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
RPS29P62273 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
RPS29P62273 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
RPS29P62273 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
RPS29P62273 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
RPS29P62273 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
RPS29P62273 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
RPS29P62273 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
RPS29P62273 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
RPS29P62273 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
RPS29P62273 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
RPS29P62273 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
RPS29P62273 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
RPS29P62273 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
RPS29P62273 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
RPS29P62273 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
RPS29P62273 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
RPS29P62273 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
RPS29P62273 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
RPS29P62273 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
RPS29P62273 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
RPS29P62273 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
RPS29P62273 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
RPS29P62273 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
RPS29P62273 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
RPS29P62273 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
RPS29P62273 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
RPS29P62273 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
RPS29P62273 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
RPS29P62273 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
RPS29P62273 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
RPS29P62273 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
RPS29P62273 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC9.72□□□□□ -0.85
RPS29P62273 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
RPS29P62273 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
RPS29P62273 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
RPS29P62273 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
RPS29P62273 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
RPS29P62273 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
RPS29P62273 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
RPS29P62273 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
RPS29P62273 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
RPS29P62273 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
RPS29P62273 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
RPS29P62273 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
RPS29P62273 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
RPS29P62273 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
RPS29P62273 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
RPS29P62273 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
RPS29P62273 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
RPS29P62273 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
RPS29P62273 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
RPS29P62273 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
RPS29P62273 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
RPS29P62273 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
RPS29P62273 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
RPS29P62273 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
RPS29P62273 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
RPS29P62273 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
RPS29P62273 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
RPS29P62273 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
RPS29P62273 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
RPS29P62273 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
RPS29P62273 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
RPS29P62273 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
RPS29P62273 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
RPS29P62273 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
RPS29P62273 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
RPS29P62273 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
RPS29P62273 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
RPS29P62273 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
RPS29P62273 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
RPS29P62273 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
RPS29P62273 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
RPS29P62273 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
RPS29P62273 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
RPS29P62273 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
RPS29P62273 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
RPS29P62273 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
RPS29P62273 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
RPS29P62273 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
RPS29P62273 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
RPS29P62273 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
RPS29P62273 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
RPS29P62273 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC9.71□□□□□ -0.86
RPS29P62273 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
RPS29P62273 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
RPS29P62273 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
RPS29P62273 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
RPS29P62273 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
RPS29P62273 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
RPS29P62273 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
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