Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms