Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
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PGGT1BP53609 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
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PGGT1BP53609 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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PGGT1BP53609 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
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PGGT1BP53609 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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PGGT1BP53609 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
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