Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PBX2P40425 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PBX2P40425 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PBX2P40425 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PBX2P40425 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PBX2P40425 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PBX2P40425 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PBX2P40425 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PBX2P40425 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PBX2P40425 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PBX2P40425 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PBX2P40425 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PBX2P40425 AC013391.2-201ENST00000559041 501 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PBX2P40425 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PBX2P40425 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PBX2P40425 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PBX2P40425 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PBX2P40425 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PBX2P40425 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PBX2P40425 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PBX2P40425 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PBX2P40425 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PBX2P40425 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PBX2P40425 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PBX2P40425 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PBX2P40425 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PBX2P40425 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PBX2P40425 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PBX2P40425 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PBX2P40425 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PBX2P40425 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PBX2P40425 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PBX2P40425 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PBX2P40425 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PBX2P40425 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PBX2P40425 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PBX2P40425 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PBX2P40425 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PBX2P40425 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PBX2P40425 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PBX2P40425 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PBX2P40425 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PBX2P40425 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PBX2P40425 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PBX2P40425 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PBX2P40425 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PBX2P40425 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PBX2P40425 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PBX2P40425 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PBX2P40425 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PBX2P40425 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PBX2P40425 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PBX2P40425 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PBX2P40425 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PBX2P40425 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PBX2P40425 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PBX2P40425 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PBX2P40425 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PBX2P40425 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PBX2P40425 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PBX2P40425 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PBX2P40425 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PBX2P40425 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PBX2P40425 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PBX2P40425 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PBX2P40425 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PBX2P40425 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PBX2P40425 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PBX2P40425 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PBX2P40425 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PBX2P40425 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PBX2P40425 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PBX2P40425 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PBX2P40425 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PBX2P40425 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PBX2P40425 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PBX2P40425 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PBX2P40425 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PBX2P40425 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PBX2P40425 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PBX2P40425 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PBX2P40425 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PBX2P40425 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PBX2P40425 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PBX2P40425 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PBX2P40425 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PBX2P40425 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PBX2P40425 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PBX2P40425 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PBX2P40425 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PBX2P40425 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PBX2P40425 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PBX2P40425 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PBX2P40425 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PBX2P40425 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PBX2P40425 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PBX2P40425 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PBX2P40425 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PBX2P40425 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PBX2P40425 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms