Protein–RNA interactions for Protein: P29353

SHC1, SHC-transforming protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC1P29353 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHC1P29353 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHC1P29353 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHC1P29353 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHC1P29353 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHC1P29353 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHC1P29353 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHC1P29353 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHC1P29353 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SHC1P29353 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHC1P29353 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHC1P29353 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHC1P29353 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHC1P29353 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SHC1P29353 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHC1P29353 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHC1P29353 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHC1P29353 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SHC1P29353 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHC1P29353 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHC1P29353 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SHC1P29353 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SHC1P29353 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SHC1P29353 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SHC1P29353 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SHC1P29353 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SHC1P29353 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SHC1P29353 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SHC1P29353 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SHC1P29353 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SHC1P29353 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SHC1P29353 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SHC1P29353 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SHC1P29353 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SHC1P29353 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHC1P29353 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHC1P29353 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHC1P29353 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHC1P29353 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHC1P29353 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHC1P29353 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHC1P29353 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHC1P29353 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHC1P29353 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHC1P29353 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHC1P29353 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHC1P29353 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHC1P29353 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHC1P29353 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHC1P29353 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHC1P29353 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHC1P29353 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHC1P29353 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHC1P29353 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHC1P29353 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SHC1P29353 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHC1P29353 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHC1P29353 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHC1P29353 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHC1P29353 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHC1P29353 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHC1P29353 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHC1P29353 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHC1P29353 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHC1P29353 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHC1P29353 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHC1P29353 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHC1P29353 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SHC1P29353 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SHC1P29353 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SHC1P29353 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SHC1P29353 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHC1P29353 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHC1P29353 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHC1P29353 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHC1P29353 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHC1P29353 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHC1P29353 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHC1P29353 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHC1P29353 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHC1P29353 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHC1P29353 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHC1P29353 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHC1P29353 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHC1P29353 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHC1P29353 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHC1P29353 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHC1P29353 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SHC1P29353 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SHC1P29353 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHC1P29353 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHC1P29353 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHC1P29353 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHC1P29353 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHC1P29353 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHC1P29353 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHC1P29353 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHC1P29353 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHC1P29353 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHC1P29353 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms