Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms