Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRZ1P23471 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms